MÉDICOS AUTÓNOMOS · GUÍA FISCAL
    Daniel Perla · Co-fundador y BDR

    Daniel Perla · Co-fundador y BDR

    Última actualización: 4 octubre 2026|Fuentes oficiales enlazadas

    Fiscalidad de médicos autónomos.

    IAE, IVA sanitario e IRPF según cómo trabajas.

    El IAE de medicina diferencia el grupo 831 para medicina general y el 832 para especialistas. La exención de IVA depende del servicio sanitario, y la retención de IRPF, del pagador. Separa consultas a pacientes, colaboraciones con clínicas y otras actividades antes de definir tus impuestos.

    Antes de tu primera factura

    La actividad y el cliente determinan el tratamiento

    • Medicina generalIAE 831 · sección 2
    • EspecialistasIAE 832 · sección 2
    • Asistencia sanitariaExención según finalidad
    • Retención profesional15 %; 7 % con requisitos

    REFERENCIA LEGAL

    Fuentes: tarifas IAE, Ley del IVA y Reglamento del IRPF

    831 / 832

    IAE profesional médico

    Art. 20.Uno.3.º

    Asistencia sanitaria e IVA

    70 %

    Ingresos retenidos: revisar modelo 130

    EL CASO FISCAL EMPIEZA POR TU FORMA DE TRABAJAR

    Una consulta propia y una colaboración con un hospital pueden compartir profesión, pero no necesariamente facturación, gastos u obligaciones. Describe quién presta el servicio, quién lo paga y si existe relación laboral o actividad por cuenta propia.

    Esta guía trata el marco común de AEAT. Si tributas ante una Hacienda Foral, en Canarias, Ceuta o Melilla, habrá que adaptar modelos y normativa. Los ejemplos son supuestos didácticos, no expedientes de clientes ni presupuestos personales.

    Guía principalIVA exento para profesionales sanitariosCentro temáticoAutónomos y RETA

    ¿Qué IAE de medicina corresponde a un médico autónomo?

    Respuesta directa: En la sección segunda del IAE, medicina general corresponde al grupo 831 y médicos especialistas al 832, con exclusión de estomatólogos y odontólogos. No hay que confundir estos grupos profesionales con los empresariales de hospitales y clínicas. La clasificación se elige por la actividad efectivamente prestada.

    El IAE es el Impuesto sobre Actividades Económicas. Sus tarifas distinguen actividades empresariales y profesionales: el mismo número en una sección diferente puede tener otro significado. Por eso buscar solo «831» sin indicar la sección puede llevar a una ficha que no describe medicina.

    Actividad profesional individualSección y grupoQué comprobar antes del alta
    Medicina generalSegunda · 831Servicios que se prestan por cuenta propia
    Especialidad médicaSegunda · 832Especialidad y exclusión de estomatólogos y odontólogos
    Estomatología / odontologíaSegunda · 833 / 834Actividad concreta, sin usar el 832 por defecto
    FisioterapiaSegunda · 836Profesión distinta: consultar su guía específica
    Hospital o clínica como actividad empresarialRevisar sección primeraTitularidad, organización y servicios del centro

    Las personas físicas están exentas del pago del IAE, pero deben identificar su actividad en el censo. No es correcto aplicarles de forma universal la regla del millón de euros propia de otros supuestos. Consulta la tarifa oficial del IAE y contrasta la actividad con el alta censal.

    El CNAE clasifica estadísticamente la actividad y no reemplaza al IAE. Puedes orientarte con el conversor IAE–CNAE, pero una equivalencia automática no decide el encuadre de una consulta que también ofrece formación, peritajes o venta de productos. Detalla cada línea de actividad y evita copiar el código de otro profesional sin revisar su situación.

    ¿Qué tengo que revisar antes de darme de alta como médico autónomo?

    Empieza por el contrato y la forma de prestar los servicios. ¿Atiendes directamente a pacientes, facturas a una clínica o trabajas con nómina? El alta por cuenta propia corresponde a una actividad real de ese tipo; no debe usarse para encubrir una relación laboral. La organización del trabajo y las condiciones del contrato importan.

    1. Identifica la actividad, el lugar de ejercicio, la especialidad y quién será el destinatario de las facturas.
    2. Comprueba con el colegio y el centro los requisitos profesionales, autorizaciones y cobertura de responsabilidad civil aplicables.
    3. Prepara el alta censal en Hacienda mediante modelo 036, con actividad, fecha de inicio y obligaciones que correspondan.
    4. Revisa el encuadramiento en RETA o la posibilidad de una mutualidad alternativa autorizada antes de iniciar la actividad.
    5. Configura facturas, libros y conservación de justificantes; separa los documentos fiscales de las historias clínicas.

    La Seguridad Social indica que el alta en RETA es previa al inicio y puede tramitarse hasta 60 días naturales antes. No son 60 días después del alta de Hacienda. Coordina ambas fechas y conserva los justificantes; un formulario enviado no equivale a comprobar que se ha resuelto correctamente.

    Si ya has comenzado sin completar un trámite, explica la fecha real de inicio para revisar la regularización. No cambies una fecha solo para que coincida con un calendario. La guía del modelo 036 ayuda a preparar los datos, aunque una actividad sanitaria mixta necesita revisar sus casillas específicas.

    ¿Cuándo está exenta de IVA la asistencia médica?

    La exención sanitaria del artículo 20.Uno.3.º de la Ley del IVA se vincula a la asistencia a personas físicas prestada por profesionales médicos o sanitarios con finalidad de diagnóstico, prevención o tratamiento de enfermedades. Es una exención, no un tipo de IVA del 0 %.

    Que pague una clínica o una aseguradora no elimina por sí solo la exención del servicio asistencial. La pregunta fiscal es qué prestación realizas. Un informe cuyo objetivo principal es asesorar a un tercero, una intervención estética sin finalidad terapéutica o una venta de productos requieren un análisis distinto; no basta con que el emisor sea médico.

    ServicioPunto que determina el análisisQué documentar
    Consulta o tratamiento sanitarioFinalidad asistencial y profesional habilitadoDescripción fiscal del servicio sin revelar diagnósticos
    Medicina estéticaFinalidad terapéutica o exclusivamente estéticaServicios diferenciados y criterio de tributación
    Informe o peritajeObjetivo del encargoContrato, destinatario y alcance del informe
    Formación o productosNormas propias de esa prestación o entregaActividad separada, factura y tratamiento aplicable

    Si tu consulta combina actividades exentas y gravadas, organiza las ventas por categorías y los gastos por destino. Puede ser necesario revisar prorrata o sectores diferenciados para el IVA soportado. Un porcentaje calculado sobre toda la caja del mes no es suficiente para decidir una deducción.

    Antes de emitir una factura dudosa, aclara el servicio con tu asesor sin enviar la historia clínica del paciente. La guía de IVA exento para sanitarios desarrolla la distinción entre profesión y finalidad. Conserva un criterio coherente para servicios iguales y revisa los cambios cuando añadas una nueva actividad.

    ¿Qué retención de IRPF pongo al facturar a una clínica?

    La retención es un pago a cuenta del impuesto del profesional que ingresa el pagador cuando está obligado a retener. En honorarios profesionales el tipo general es el 15 %. El artículo 95 del Reglamento del IRPF permite el 7 % al iniciar actividad, durante el año de inicio y los dos siguientes, si se cumplen sus requisitos.

    Entre esos requisitos están no haber ejercido actividad profesional en el año anterior y comunicar la circunstancia al pagador. No son «dos años» contados desde el día del alta. Si empiezas en noviembre, ese año ya es el de inicio. Conserva la comunicación y revisa cuándo termina el periodo reducido.

    Cuando el cliente es un paciente particular que actúa como tal, normalmente no practica retención. Cuando cobras de una clínica, revisa quién paga jurídicamente y si tiene obligación de retener. La exención de IVA y la retención de IRPF son decisiones distintas: una factura sanitaria puede estar exenta de IVA y tener retención.

    Comprueba que el importe retenido en tus facturas coincide con los certificados del pagador y la información fiscal. Si una clínica te envía una liquidación, identifica honorarios, retención, comisiones u otros conceptos antes de registrar únicamente el ingreso neto en el banco. Una diferencia de cobro puede ser una retención, no una factura impagada.

    ¿Cómo quedan una factura a una clínica y otra a un paciente?

    Estos ejemplos son didácticos: suponen asistencia médica exenta en territorio IVA común y no sustituyen la revisión de un encargo concreto. El ejemplo a clínica utiliza el tipo general de retención y presupone que el destinatario está obligado a retener.

    ConceptoPaciente particularClínica obligada a retener
    Honorarios100 €1.000 €
    IVAExento, si correspondeExento, si corresponde
    Retención IRPFSin retención en este supuesto15 %: 150 €
    Importe que se cobra100 €850 €
    Ingreso profesional antes de gastos100 €1.000 €

    En la factura a la clínica, los 150 € retenidos no reducen tus honorarios a 850 €. Son un anticipo del IRPF. Registra la base y la retención por separado para que los libros, las liquidaciones del centro y la Renta puedan conciliarse.

    La factura debe contener la identificación fiscal que corresponda, número, fecha, descripción del servicio y tratamiento del impuesto. No incluyas síntomas, diagnóstico ni detalles clínicos innecesarios. La documentación de asistencia y el justificante fiscal tienen funciones distintas y pueden requerir canales diferentes.

    Puedes comprobar la estructura con el generador de factura PDF. Una plantilla no selecciona por ti la exención ni acredita que tu proceso informático cumpla todas las obligaciones de facturación. Al elegir software, pide información sobre los requisitos aplicables a tu actividad y conserva tus registros de forma ordenada.

    ¿Qué modelos presenta un médico autónomo exento de IVA?

    No existe un calendario idéntico para todos los médicos. La obligación de presentar IVA, pagos fraccionados de IRPF o retenciones depende de la actividad, los ingresos y otras operaciones. Define el calendario desde el alta censal y revisa sus cambios cuando contrates personal, alquiles un local o añadas servicios.

    Quien realiza exclusivamente operaciones exentas de los artículos 20 y 26 no está obligado a presentar autoliquidaciones periódicas de IVA ni el resumen anual por esas operaciones, conforme al artículo 71 del Reglamento del IVA. No hay que presentar siempre el 390 por ser médico. Determinadas operaciones especiales pueden generar obligaciones adicionales.

    Para el modelo 130, la AEAT explica la regla del 70 % de ingresos retenidos: se utiliza el año anterior y, al inicio, el periodo del pago fraccionado. Cuenta euros de ingresos, no facturas. Dos facturas a una clínica pueden representar más ingresos que muchas consultas particulares.

    SituaciónQué revisar con el asesor
    Solo asistencia sanitaria exentaAlta censal, libros, IRPF y posibles operaciones especiales
    Facturas principalmente a clínicas con retenciónPorcentaje de ingresos retenidos y obligación de modelo 130
    Asistencia y servicios gravadosIVA, deducciones, declaraciones y separación de operaciones
    Consulta con empleados o alquilerRetenciones del personal o arrendamiento, según contrato

    Guarda tanto las declaraciones presentadas como sus justificantes de pago o domiciliación. Una gestoría debe indicar qué modelos asume y cuáles requieren contratación adicional. No interpretes que «IVA exento» significa estar exento de IRPF, de llevar registros o de todas las obligaciones informativas.

    ¿Puedo elegir una mutualidad alternativa en lugar del RETA?

    Una mutualidad alternativa es una entidad autorizada para cubrir el encuadramiento de determinados profesionales en las condiciones legalmente previstas. No debe confundirse con una mutua colaboradora de Seguridad Social, un seguro médico o un producto privado de ahorro.

    La disposición adicional decimoctava de la Ley General de la Seguridad Social regula el encuadramiento de profesionales colegiados. Antes de optar, verifica por escrito que la entidad y el producto sirven como alternativa para tu actividad y que tu situación permite esa elección. El nombre comercial de una póliza no lo acredita.

    • Actividad cubierta y prueba de la admisión como alternativa.
    • Aportaciones, coberturas, periodos de carencia y condiciones de prestaciones.
    • Compatibilidad con otras actividades y trabajo por cuenta ajena.
    • Consecuencias de una elección o cambio y normativa vigente en la fecha de la decisión.

    No recomendamos una modalidad solo por la cuota del primer mes. Pide una comparación personal y confirma con la entidad y la Tesorería el encuadramiento que te corresponda. Esta guía no atribuye a PSN una alternativa universal ni publica cuotas de RETA o mutualidades que dependan de tu situación.

    ¿Cómo justifico los gastos de una consulta médica?

    Para revisar un gasto necesitas identificar su relación con la actividad, conservar el justificante adecuado y registrarlo correctamente. Colegiación, seguro profesional, alquiler, material sanitario o formación relacionada con el ejercicio pueden requerir tratamientos distintos. No hay un ahorro fiscal idéntico para todos ni un porcentaje único de amortización para cualquier equipo.

    Separa gastos corrientes de inversiones que se utilizan durante varios ejercicios. Un ecógrafo, un ordenador y el material consumible no tienen por qué registrarse igual. Conserva factura, fecha de puesta en funcionamiento, forma de pago y uso profesional para analizar si corresponde amortización y bajo qué reglas.

    También separa IRPF e IVA. Un gasto relacionado con la actividad puede formar parte de los gastos o del coste de una inversión en IRPF sin que su IVA sea recuperable. Si solo realizas asistencia exenta, no deduzcas el IVA soportado de forma automática. En actividad mixta habrá que revisar cada categoría.

    En una consulta compartida, documenta quién contrata el espacio, quién recibe la factura y qué parte corresponde a cada profesional. Un reparto verbal o una transferencia al compañero no demuestra por sí solo el gasto de tu actividad. Lleva al asesor el contrato y el sistema de liquidación antes de cerrar el trimestre.

    ¿Qué cambia si tengo nómina en un hospital y consulta privada?

    La nómina y los honorarios de una actividad propia se registran por separado. Cotizar como empleado no elimina automáticamente el encuadramiento de la actividad privada. La pluriactividad describe la coexistencia de trabajo por cuenta ajena y por cuenta propia; sus efectos deben revisarse con los datos de ambos.

    Antes de abrir consulta, confirma los requisitos de compatibilidad que afecten a tu puesto, especialmente si trabajas en el sector público. La fiscalidad no resuelve una autorización profesional o administrativa. Presenta al asesor la forma de contratación y las fechas, sin entregar información clínica ni datos de pacientes.

    Cuando solo trabajas con nómina, esta guía de actividad económica no convierte tu salario en ingresos de autónomo. Si empiezas una colaboración nueva, comprueba si será relación laboral o actividad independiente antes de emitir facturas. Así evitas tomar decisiones a partir del título del contrato o de cómo te solicita el centro que cobres.

    ¿Qué debo pedir a una gestoría especializada en médicos?

    Pide una propuesta que parta de tu especialidad, la forma de trabajar y las actividades que facturas. Debe explicar quién revisa el alta, qué declaraciones presenta, cómo se entregan los documentos y qué ocurre si recibes una notificación. Si mezclas asistencia y estética, pregunta expresamente cómo se separan y revisan.

    Para preparar un presupuesto basta con información del negocio: territorio fiscal, consulta propia o centros, facturas por trimestre, servicios, empleados y gestoría actual. No envíes historias clínicas por WhatsApp para pedir precio. Si ya tienes asesor, prepara alta censal, modelos presentados y libros para estudiar el traspaso sin perder documentación.

    La gestoría de Billeo para médicos autónomos parte del plan general desde 65 €/mes más IVA, con hasta 15 facturas por trimestre. El plan de 95 €/mes más IVA contempla hasta 100 facturas trimestrales. En País Vasco y Navarra, incluidos Donostia y las demás localidades forales, los autónomos parten de 120 €/mes más IVA.

    Confirma el presupuesto según tu operativa. La Renta anual se contrata aparte, para clientes desde 40 €, y otros servicios se detallan antes de empezar. Puedes revisar precios y alcance o el proceso de cambio de gestoría. El precio de entrada no debe interpretarse como cobertura ilimitada para una clínica con empleados, varias actividades o incidencias anteriores.

    Para organizar la fiscalidad médica, identifica el IAE profesional, clasifica cada servicio y revisa las retenciones según el pagador. Lleva un registro que permita comprobar las facturas y los impuestos. Una propuesta de gestoría útil debe explicar cómo resolverá tu actividad concreta y qué incluye su presupuesto.

    ¿Dónde compruebo la normativa de esta guía?

    Fuentes oficiales consultadas para esta actualización editorial del 4 de octubre de 2026. Las tarifas y los modelos se deben aplicar al territorio y a la situación real del profesional. La guía ayuda a preparar tu actividad y no sustituye la revisión de tus documentos.

    FAQs frecuentes

    ¿Qué IAE corresponde a un médico autónomo?
    La sección segunda del IAE distingue el grupo 831 para médicos de medicina general y el 832 para médicos especialistas, excluidos estomatólogos y odontólogos. Los grupos empresariales de hospitales o clínicas no sustituyen automáticamente el alta profesional individual. Hay que elegir por la actividad que se ejerce.
    ¿Tengo que pagar IAE por estar en el grupo 831 o 832?
    Las personas físicas están exentas del pago del IAE. Eso no elimina el alta censal de la actividad en Hacienda. Estar dado de alta en un grupo y tener que pagar una cuota de IAE son obligaciones diferentes.
    ¿Las facturas de un médico llevan IVA?
    La asistencia prestada por profesionales médicos o sanitarios para diagnosticar, prevenir o tratar enfermedades puede estar exenta conforme al artículo 20.Uno.3.º de la Ley del IVA. El título de médico por sí solo no hace que cualquier servicio, venta de productos o intervención estética esté exento.
    ¿Cuándo aplica un médico el 7 % o el 15 % de retención?
    En los honorarios profesionales pagados por un obligado a retener, el tipo general es el 15 %. El 7 % puede aplicarse en el año de inicio y los dos siguientes si no se ejerció actividad profesional en el año anterior y se comunica la circunstancia al pagador. Un paciente particular normalmente no practica retención.
    ¿Un médico exento de IVA presenta los modelos 303 y 390?
    Quien realiza exclusivamente operaciones exentas de los artículos 20 y 26 de la Ley del IVA no presenta las autoliquidaciones periódicas ni el resumen anual por esas operaciones. Una compra intracomunitaria u otra operación especial puede generar obligaciones adicionales; el alta censal debe reflejar la actividad real.
    ¿Cuándo debe presentar el modelo 130 un médico?
    Los profesionales no efectúan pagos fraccionados por esa actividad si al menos el 70 % de los ingresos del año anterior estuvo sujeto a retención o ingreso a cuenta. Al iniciar actividad se comprueba el porcentaje en el periodo del pago fraccionado. El porcentaje se mide sobre ingresos, no sobre el número de facturas.
    ¿Puedo facturar a una clínica sin darme de alta?
    Si ejerces una actividad profesional por cuenta propia, hay que revisar el alta censal y el encuadramiento de Seguridad Social antes de empezar. Si realmente existe una relación laboral, el tratamiento es distinto. Tener un contrato titulado colaboración o emitir pocas facturas no resuelve por sí solo esa distinción.
    ¿RETA o mutualidad alternativa para un médico?
    Debe comprobarse si el profesional puede acogerse a una mutualidad autorizada como alternativa para su actividad y si cumple sus condiciones. Un seguro de ahorro o una póliza de salud no sustituye automáticamente el RETA. Antes de elegir conviene comparar coberturas, aportaciones, compatibilidad y consecuencias de un cambio.
    ¿Puedo deducir todo el IVA del equipo de mi consulta?
    No automáticamente. La actividad sanitaria exenta suele no dar derecho a deducir el IVA de sus compras. Cuando conviven servicios con y sin derecho a deducción hay que revisar la asignación de gastos, la prorrata y, en su caso, sectores diferenciados. La deducción de un gasto en IRPF es otra cuestión.
    ¿Cuánto cuesta la gestoría de Billeo para médicos?
    El plan de autónomos parte de 65 €/mes más IVA, con hasta 15 facturas por trimestre; el plan de 95 €/mes más IVA permite hasta 100 facturas por trimestre. En País Vasco y Navarra la tarifa de autónomos parte de 120 €/mes más IVA. Los modelos incluidos y los servicios adicionales se confirman en el presupuesto. La Renta se contrata aparte.

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    PROFESIONALES SANITARIOS

    Revisa la gestión fiscal de tu actividad sanitaria.

    Indica tu profesión, si tienes consulta propia o colaboras con centros y qué servicios facturas. No envíes datos de pacientes; con la información de tu actividad prepararemos el alcance de la revisión.

    • Actividad y forma de trabajar
    • Facturación y gastos
    • Alcance del servicio por escrito

    Sin promesas automáticas: primero confirmamos documentación, alcance y precio aplicable.