Baja por enfermedad del autónomo: cuanto cobras y trámites

La baja por enfermedad del autónomo, técnicamente llamada Incapacidad Temporal (IT), es la prestación económica que recibe un trabajador del RETA cuando no puede ejercer su actividad temporalmente por enfermedad común, enfermedad profesional o accidente (laboral o no laboral). Está regulada en la Ley General de la Seguridad Social y gestionada por la Mutua colaboradora del autónomo.

La baja por enfermedad del autónomo es una de las prestaciones más importantes del RETA: sin ella, una enfermedad de varias semanas puede destruir económicamente al autónomo. Desde 2019, la cotización por contingencias profesionales es obligatoria, lo que automáticamente cubre baja médica común y profesional.

Existen dos tipos de baja por enfermedad del autónomo: contingencias comunes (enfermedad o accidente no laboral) y contingencias profesionales (enfermedad profesional o accidente de trabajo). Los porcentajes y plazos de cobro son diferentes en cada caso.

La cuantía de la baja por enfermedad del autónomo depende del tipo de contingencia y de la base de cotización. Tabla oficial:

La cuantía real de la baja por enfermedad del autónomo depende directamente de la base de cotización elegida. Ejemplos típicos en 2026:

• Base mínima (660 €/mes) → baja ~400-490 €/mes
• Base media (1.500 €/mes) → baja ~900-1.125 €/mes
• Base alta (2.500 €/mes) → baja ~1.500-1.875 €/mes
• Base máxima (4.139 €/mes) → baja ~2.500-3.100 €/mes

Importante: durante la baja, el autónomo sigue obligado a pagar la cuota RETA completa. La prestación se paga mensualmente con retención de IRPF.

El procedimiento para tramitar la baja por enfermedad del autónomo es:

1. Acudir al médico: el autónomo va al médico de cabecera de la Seguridad Social, que evalúa la enfermedad y emite el parte de baja inicial con diagnóstico CIE y duración estimada.
2. Comunicar a la Mutua en 3 días: el autónomo presenta a su Mutua colaboradora (Fraternidad, FREMAP, MC, Asepeyo, etc.) el parte de baja junto con: solicitud oficial de prestación, declaración de cese temporal de actividad, datos bancarios.
3. Partes de confirmación: durante la baja, el médico emite partes de confirmación cada 7 días (al principio) y luego cada 14-28 días según evolución. Hay que presentarlos también a la Mutua.
4. Cobro mensual: la Mutua paga la prestación cada mes en la cuenta bancaria indicada, con retención de IRPF aplicable (habitualmente 2%).
5. Parte de alta médica: cuando el médico considera que el autónomo puede volver a trabajar, emite parte de alta. El autónomo debe comunicarlo a la Mutua y reiniciar la actividad.

La baja por enfermedad del autónomo tiene plazos legales máximos:

• Plazo inicial: 365 días (12 meses). Durante este periodo el médico emite partes de confirmación periódicos.
• Prórroga extraordinaria: si pasados los 365 días el autónomo aún no puede volver a trabajar, la inspección médica del INSS puede prorrogar la baja 180 días más (total máximo 545 días = 18 meses).
• Derivación a Incapacidad Permanente: pasados los 545 días, si el autónomo aún no puede volver a trabajar, el caso se deriva a Incapacidad Permanente (parcial, total, absoluta o gran invalidez) con prestación distinta y permanente.
• Inspecciones médicas: a lo largo de la baja por enfermedad del autónomo, la Mutua y el INSS pueden citar al autónomo para inspecciones médicas que verifiquen la procedencia de la baja.

Los seguros privados de Incapacidad Temporal (IT) son una de las inversiones más rentables para el autónomo. Complementan la baja por enfermedad del autónomo en dos áreas:

• Cobertura primeros 3 días: la Seguridad Social NO paga los primeros 3 días de baja por enfermedad común. Los seguros privados sí los cubren, evitando ese hueco económico.
• Aumento del porcentaje: los seguros privados aumentan el % de cobertura hasta el 100% de tus ingresos habituales (vs 60-75% de la base reguladora). Útil para autónomos que cotizan por base baja pero ingresan más.
• Indemnizaciones por enfermedades graves: muchos seguros incluyen pagos únicos al diagnosticar enfermedades graves (cáncer, infarto, etc.) que ayudan a cubrir gastos médicos no cubiertos por la Seguridad Social.

Primas medias de seguros IT en 2026: 30-100 €/mes según edad, profesión, nivel de cobertura y franquicia. Muy recomendable para autónomos con liquidez limitada o sin ahorros que cubran 2-3 meses sin ingresos.